در هر رده از سازمان، معاونتهای 11گانه ایجاد می شوند و وظایف خود را زیر نظر معاونت بالادست خود در بخش مربوط به خود، انجام می دهند.

معاونتهای کانگ فو توآ۲۱ در نظر دارند با تلاش مداوم، اهتمام و همیاری پژوهشگران، همراهان و مربیان سراسر کشور در راستای اهداف انجمن کانگ فو توآ ۲۱ که همانا رشد، ارتقا و بالندگی انسان در ابعاد تن و روان می باشد به نحوی گام بردارد تا این انجمن به عنوان یکی از نهادهای پیشرو و  نوآور، که دارای ظرفیت گسترده و نیروی انسانی عظیم می باشد، در گستره پژوهش­های مرتبط با ورزش، آموزش علوم ورزش و همچنین پیشگام در عرصه تولید و اشاعه علم و فنآوری های نوین ورزشی و سایر علوم در سطح کشور شناخته شود.